“我军北上，制造局的军需生产不能断了供应，所以兄弟留一个团下来，负责监督生产。”方剑雄把话说完，陈其美虽然还是很愤怒，但只能平静的接受。
大军开拔不是小事，陈其美还得继续出力。沪宁铁路上能找到的车皮，陈其美都派兵征用了，安徽军的装备和人员，有序的按照计划上车，次第开往南京。
第一列火车开出车站的时候，陈其美总算是松了一口气，安徽军总算是走了。这上海滩总算是自己说了算了。唯一的遗憾是江南制造局，方剑雄霸占不让，陈其美无可奈何。
方剑雄虽然死要钱，但名声不错，说话也算话，陈其美觉得自己做大事的人，这点还是能忍耐下来。
安徽军威震东南的时候，湖北方面却在面临极大的困境。袁世凯亲自到湖北孝感督战之后，冯国璋率军猛攻汉口，民军退入城区打巷战，冯国璋见伤亡不小，下令放火。大火烧了三天三夜，汉口失陷。
汉口军分政府撤退，为首詹大悲、何海鸣等人长期与孙武不和，恐回武昌遭其所害，转往安庆而去，试图寻求吴旸谷的支持。
另有胡瑛者，汉口激战之际，召开秘密会议，称汉口不守，当寻求它路。10月30日夜，守卫汉阳的湖北第一协统宋锡全伙同王宪章率部撤离汉阳，往湖南方向而去。黎元洪致电湖南。杀宋锡全。脑袋送到武昌示众。王宪章被囚，后得蒋翊武等力保获释。
此二事，往浅里说是文学社和共进会之间的矛盾一种表现方式。往深里说，折射出在武昌这个革命首义的战场上，在大敌当前的局面下，竟不能上下一致，犹自内斗不已。
这两件事情之后，黎元洪通过孙武之手，进一步掌握了湖北军政大权。
汉口大火，激起全国义愤。清资政院总裁李家驹在奏折中称：“十三日（11月3日）接南省个团体电称。汉口并附近一带地方，官军恣意残杀，惨及妇孺，焚烧街市。绵恒十余里，奸淫掳掠，无所不至。人心愤激，达到极点。”
清政府一面表示要赔偿民众损失，一面嘉奖作战有功人员。汉口之战后，武汉战事暂停。
湖北军政府内部又出争执，同盟会、文学社力主黄兴为湖北、湖南大都督或者南方民军总司令，以便统一军事权。共进会、立宪派及旧军官坚决反对，认为有一个战时总司令就够了。打完仗你这个总司令就自动取消，别把自己太当一盘菜。双上争执激烈。后由宋教仁调停，采取后一种意见。这应该看做是黎元洪的一次胜利。11月3日，黎元洪设拜将台，给足了黄兴的面子“黄总司令”登台。真不知道这个黄总司令哪来的自信心指挥的了千军万马去打仗，大约觉得自己啥都行吧。
湖北胜利清政府固然高兴，不料东南杀出一个方剑雄，取安庆，下江宁，进而横扫沪宁线。清政府最为富庶的统治地区。数日之间化为乌有。
清政府责令河南提督倪嗣冲火速南下，倪嗣冲电称缺械少饷，要这个要那个，死活不挪窝。最后还是袁世凯说了话，倪嗣冲得了安徽布政司的官衔。这才率部出发。
倪嗣冲率五千人出河南周口，先占领太和县。后猛攻颍上，打死淮上官兵千余人。接着又占领阜阳，屠杀百姓五千余，气焰嚣张至极。
制造局生产恢复的过程并没那么简单，江南制造局的工人有技术不假，但是采取的工作方式较为传统，生产效率低下。方剑雄在上海的工作重心，就是重新整顿江南制造局。芜湖方面调来的人手进驻制造局，中方人员技术方面为首的是田三斤。
这个当初被制造局撵出来的朴实汉子，获悉上海要人来整顿的时候，主动报名要求回来。
方剑雄把其他事情丢给郑权等人去办，亲自陪着芜湖方面来的人员吃了顿饭。田三斤在芜湖这两年，技术上更进一步，管理上也有所提高。芜湖那一套比较现代的生产管理办法，田三斤基本掌握。
方剑雄对他有印象，所以在众人之中与之握手道：“这位是田三斤师傅吧！我记得你是从上海去的芜湖，这一次也是主动要求回来的？”方剑雄功课做的很足，这些技术苗子，给黄金不换啊。在他们面前，方剑雄亲切起来要多虚伪有多虚伪，总之要这些人死心塌地才行。
田三斤还是第一次这么近距离接触方剑雄这个大老板，很是激动也很是不安道：“当年确实是从江南制造局出来的，这次主动回来小的也是有点私心。”